Jau 1946-1948 m. Ignalinoje veikė gimnazija, 1949 m. tapusi vidurine mokykla.Antrą kartą gimnazijos vardas Ignalinoje nuskambėjo 2002-07-15. Iškilmingas gimnazijos atidarymas vyko 2002-09-02.
Ignalinos rajono Vidiškių gimnazija pradėta statyti 1988 metais. 1992 m. rugsėjo 1 dieną ji duris mokiniams atvėrė kaip devynmetė bendrojo lavinimo mokykla.1995 metų rudenį mokykla tapo vidurine.
